Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Crocc2F6XLV1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Crocc2F6XLV1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms