Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Y3

Ccdc7b, Coiled-coil domain-containing 7B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7bE9Q9Y3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ccdc7bE9Q9Y3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc7bE9Q9Y3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms