Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rdh16f1E9Q9P8 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Rdh16f1E9Q9P8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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Rdh16f1E9Q9P8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rdh16f1E9Q9P8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Rdh16f1E9Q9P8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Rdh16f1E9Q9P8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rdh16f1E9Q9P8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rdh16f1E9Q9P8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Rdh16f1E9Q9P8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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