Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Col22a1E9Q7P1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Col22a1E9Q7P1 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms