Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ccdc85cE9Q6B2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms