Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm20518E9Q548 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm20518E9Q548 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms