Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ccdc71lE9Q4T4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ccdc71lE9Q4T4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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