Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Susd1E9Q3H4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Susd1E9Q3H4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms