Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Tarbp1E9Q368 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Tarbp1E9Q368 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Tarbp1E9Q368 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms