Protein–RNA interactions for Protein: E9Q328

5430401F13Rik, RIKEN cDNA 5430401F13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5430401F13RikE9Q328 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
5430401F13RikE9Q328 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
5430401F13RikE9Q328 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms