Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
NebE9Q1W3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
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