Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Pdzd2E9Q1M1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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