Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM4

Chd2, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd2E9PZM4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Chd2E9PZM4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Chd2E9PZM4 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms