Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gcom1E9PZ54 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gcom1E9PZ54 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms