Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Parp4E9PYK3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Parp4E9PYK3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms