Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3002E9PW72 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3002E9PW72 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms