Protein–RNA interactions for Protein: E9PV82

Fam53a, Protein FAM53A, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam53aE9PV82 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fam53aE9PV82 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fam53aE9PV82 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms