Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Clca3bE9PUL3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clca3bE9PUL3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms