Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cngb1E1AZ71 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cngb1E1AZ71 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cngb1E1AZ71 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms