Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Klhl3E0CZ16 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Klhl3E0CZ16 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms