Protein–RNA interactions for Protein: D6MZJ6

Smpd5, MCG22096, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd5D6MZJ6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd5D6MZJ6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Smpd5D6MZJ6 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms