Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ccdc6D3YZP9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc6D3YZP9 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms