Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rexo5D3YW29 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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Rexo5D3YW29 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Rexo5D3YW29 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Rexo5D3YW29 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Rexo5D3YW29 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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Rexo5D3YW29 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
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Rexo5D3YW29 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
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Rexo5D3YW29 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Rexo5D3YW29 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms