Protein–RNA interactions for Protein: C8YR32

Loxhd1, Lipoxygenase homology domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Loxhd1C8YR32 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Loxhd1C8YR32 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms