Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmf1B9EKI3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmf1B9EKI3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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