Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

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Length 1,276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Gm20547B8JJN0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Gm20547B8JJN0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gm20547B8JJN0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gm20547B8JJN0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Gm20547B8JJN0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm20547B8JJN0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm20547B8JJN0 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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