Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pnldc1B2RXZ1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pnldc1B2RXZ1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms