Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
1700018F24RikB2RW27 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
1700018F24RikB2RW27 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700018F24RikB2RW27 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
1700018F24RikB2RW27 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700018F24RikB2RW27 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700018F24RikB2RW27 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700018F24RikB2RW27 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700018F24RikB2RW27 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700018F24RikB2RW27 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
1700018F24RikB2RW27 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms