Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rd3lB2RV38 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rd3lB2RV38 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rd3lB2RV38 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rd3lB2RV38 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rd3lB2RV38 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rd3lB2RV38 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Rd3lB2RV38 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rd3lB2RV38 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rd3lB2RV38 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rd3lB2RV38 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rd3lB2RV38 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rd3lB2RV38 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rd3lB2RV38 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms