Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Usf3B2RUQ2 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms