Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Zscan5bB2RTN3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms