Protein–RNA interactions for Protein: B2RS76

Cpb1, Carboxypeptidase B1 (Tissue), isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpb1B2RS76 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cpb1B2RS76 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms