Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Brpf3B2KF05 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms