Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Slfn8B1ARD8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms