Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rhox1B1APN4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rhox1B1APN4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms