Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
H2-M5A7VMS3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
H2-M5A7VMS3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms