Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
4930435E12RikA6X8Z9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
4930435E12RikA6X8Z9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms