Protein–RNA interactions for Protein: A2CFD5

Btbd35f28, BTB domain-containing 35, family member 28, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f28A2CFD5 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Btbd35f28A2CFD5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms