Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tubb1A2AQ07 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tubb1A2AQ07 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms