Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rhox3fA2ANE1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rhox3fA2ANE1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms