Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GabreA2AMW3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GabreA2AMW3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms