Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Frmpd1A2AKB4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Frmpd1A2AKB4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms