Protein–RNA interactions for Protein: A2AK42

Gm13697, Predicted gene 13691, mousemouse

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13697A2AK42 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Gm13697A2AK42 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gm13697A2AK42 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms