Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
VirmaA2AIV2 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
VirmaA2AIV2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms