Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc163A2AGD7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc163A2AGD7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms