Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Prdm16A2A935 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Prdm16A2A935 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms