Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
PtprfA2A8L5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PtprfA2A8L5 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms