Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trbv2A0A0B4J1G8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trbv2A0A0B4J1G8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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Trbv2A0A0B4J1G8 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trbv2A0A0B4J1G8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Trbv2A0A0B4J1G8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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