Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXN4

Ighv1-18, Immunoglobulin heavy variable V1-18 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Ighv1-18A0A0A6YXN4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms