Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r18-202ENSMUST00000228574 14315 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm15844-201ENSMUST00000118016 576 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm11877-201ENSMUST00000118921 852 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm11816-201ENSMUST00000142744 353 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 4930522O17Rik-201ENSMUST00000155178 447 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm24212-201ENSMUST00000158258 132 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm17030-201ENSMUST00000167016 393 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Defa27-202ENSMUST00000168340 371 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm44060-201ENSMUST00000204440 410 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm2511-201ENSMUST00000205521 457 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm5358-201ENSMUST00000212814 353 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 AC153899.1-201ENSMUST00000214092 1117 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 AC158622.1-201ENSMUST00000217107 230 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 AC158631.1-201ENSMUST00000219202 138 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Olfr747-204ENSMUST00000213238 1416 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Igkv4-63-201ENSMUST00000103351 286 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm27399-201ENSMUST00000184250 78 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm5268-201ENSMUST00000189212 940 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Olfr1228-201ENSMUST00000190757 1094 ntAPPRIS P2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Obox4-ps5-201ENSMUST00000196368 397 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm43476-201ENSMUST00000197873 405 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Obox4-ps10-201ENSMUST00000199376 504 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm45380-201ENSMUST00000210465 315 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Olfr484-201ENSMUST00000210881 1098 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Olfr101-203ENSMUST00000215392 2899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Vmn2r66-201ENSMUST00000124773 2556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm14125-201ENSMUST00000113442 680 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm7974-201ENSMUST00000117154 408 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm16232-201ENSMUST00000162856 167 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm38008-201ENSMUST00000195333 518 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm43415-201ENSMUST00000201934 750 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 AC158598.1-201ENSMUST00000214349 3847 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm18704-201ENSMUST00000219736 446 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Olfr136-201ENSMUST00000077203 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm26063-201ENSMUST00000083378 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Mir322-201ENSMUST00000083484 95 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r82-203ENSMUST00000227672 3651 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Olfr509-203ENSMUST00000214861 3535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Olfr935-202ENSMUST00000214157 1693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Zfp985-201ENSMUST00000081742 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm26015-201ENSMUST00000104402 125 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm29069-201ENSMUST00000185857 675 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm29012-201ENSMUST00000187882 469 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm28639-201ENSMUST00000191519 481 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Igkv12-49-201ENSMUST00000197714 278 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm45150-201ENSMUST00000206051 467 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 AF357341-201ENSMUST00000083088 75 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 Olfr1132-202ENSMUST00000216082 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
Col4a3Q9QZS0 U2surp-202ENSMUST00000079659 7630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Gm16017-201ENSMUST00000119834 208 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Gm1993-201ENSMUST00000120268 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Gm22361-201ENSMUST00000158435 176 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Gm26004-201ENSMUST00000158804 116 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Gm7592-201ENSMUST00000160674 627 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Gm28637-201ENSMUST00000179424 345 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Gm26983-201ENSMUST00000182051 388 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Gm43922-201ENSMUST00000205071 328 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Gm8031-201ENSMUST00000213430 626 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Olfr907-202ENSMUST00000214003 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 AC159472.1-201ENSMUST00000218178 463 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Gm18871-201ENSMUST00000218655 745 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 AC144819.1-201ENSMUST00000227015 620 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Olfr1022-201ENSMUST00000054736 948 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Olfr1351-201ENSMUST00000080730 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 5730408A14Rik-201ENSMUST00000194955 1824 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Gm37470-201ENSMUST00000193378 2798 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Vmn1r21-201ENSMUST00000203310 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Olfr1129-202ENSMUST00000213315 2255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
Col4a3Q9QZS0 Dst-211ENSMUST00000183034 23201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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